Guide 13 · 한글 분류표
대학원생을 위한 클로드 연구 스킬 177개 한글 분류표
깃허브 별 5만 4천 개가 넘는 Scientific Agent Skills 저장소의 스킬 177개를 분야 7개로 나누고, 하나하나 한국어로 설명과 바로 쓰는 프롬프트를 붙였어요. (2026년 10월 27일 기준)
한눈에 보기
| 분야 | 개수 | 먼저 써 볼 스킬 |
|---|---|---|
| 논문·문헌 | 19개 | literature-review, paper-lookup |
| 글쓰기·발표 | 13개 | scientific-writing, scientific-slides |
| 데이터 분석·통계 | 31개 | statistical-analysis, exploratory-data-analysis |
| 생물·유전체 | 56개 | biopython, scanpy |
| 화학·신약 | 18개 | rdkit, medchem |
| 의학·임상 | 13개 | clinical-decision-support, pyhealth |
| 물리·공학·기타 | 27개 | sympy, pymatgen |

설치 (명령어 한 줄)
Bash
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills저장소 README의 공식 설치 방법이에요. 이렇게 깔면 지금 폴더에서 연 클로드 코드에서만 보여요. 어느 폴더에서든 쓰려면 아래처럼 -g를 붙여 주세요.
Bash
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills -s '*' -a claude-code -y --copy -g<callout icon="">
설치했는데 스킬이 안 뜨면: ① 다른 폴더에서 클로드 코드를 열었는지(→ -g로 다시 설치) ② 설치 후 클로드 코드를 새로 켰는지 ③ 클로드 앱(채팅)이 아니라 클로드 코드(터미널)인지 확인해 주세요. ls ~/.claude/skills | wc -l 결과가 177이면 정상이에요.
</callout> 스킬은 에이전트 권한으로 돌아가니 처음엔 필요한 분야만 골라 설치하고, 쓰기 전에 SKILL.md를 한 번 읽어 보세요.
써 보기: 실제 실행 결과
/literature-review 최근 3년 비만 치료제 논문 정리해 줘. 펍메드에서 찾은 실제 논문 5편만, 제목·연도·핵심 한 줄·PMID로 짧게
→ PubMed에서 NEJM 무작위대조시험 5편을 찾아 PMID까지 붙여 정리했어요(예: SURMOUNT-5, PMID 40353578).

논문·문헌 (19개)
| 스킬 | 한글 이름 | 하는 일 | 바로 쓰는 프롬프트 | 필요한 것 |
|---|---|---|---|---|
bgpt-paper-search | 논문 근거 검색 | 논문 전문에서 실험·통계·한계 등 근거 추출 검색 | /bgpt-paper-search 메트포르민 항암 효과 근거 논문 찾아 줘 | BGPT 연결 필요(유료는 API 키) |
citation-management | 인용 관리 | 논문 검색·메타데이터 검증·BibTeX 생성 | /citation-management 이 DOI 목록 BibTeX로 정리해 줘 | 없음 |
exa-search | 학술 웹 검색 | Exa로 학술·기술 웹 검색·PDF 본문 추출 | /exa-search 최근 단백질 설계 AI 논문 10개 찾아 줘 | Exa API 키 필요 |
hypogenic | 가설 자동 생성 | HypoGeniC로 라벨 텍스트 데이터에서 가설 생성 | /hypogenic 리뷰 데이터로 가설 생성 실험 설정 점검해 줘 | LLM 제공자 키 필요할 수 있음 |
hypothesis-generation | 가설 수립 | 근거 기반 연구 질문·가설·검증 예측 정리 | /hypothesis-generation 수면 부족과 비만 관계 가설 세워 줘 | 없음 |
liteparse | 문서 파싱 | PDF·오피스 문서 텍스트·좌표 추출, OCR | /liteparse 이 논문 PDF 표 위치 포함해서 텍스트 뽑아 줘 | 없음 |
literature-review | 문헌 리뷰 | PubMed·arXiv 등으로 체계적 문헌고찰 | /literature-review 최근 3년 GLP-1 비만 치료 논문 10편 정리해 줘 | AI 도식은 OpenRouter 키(선택) |
markitdown | 문서→마크다운 | PDF·워드·PPT 등을 마크다운으로 변환 | /markitdown 이 논문 PDF들 마크다운으로 바꿔 줘 | 없음 |
open-notebook | 연구 노트북 | 자체 호스팅 NotebookLM 대안으로 자료 정리·질의 | /open-notebook 논문 PDF 5개 올리고 핵심 질문해 줘 | Open Notebook 서버 필요 |
paper-lookup | 논문 조회 | 18개 학술 API로 논문·인용·오픈액세스 검색 | /paper-lookup 이 논문 인용 수랑 무료 전문 링크 찾아 줘 | 없음 |
paperclip | 생의학 논문 검색 | 생의학 논문·FDA 문서·임상시험 검색·열람 | /paperclip 펨브롤리주맙 FDA 승인 문서 찾아 줘 | Paperclip 키 또는 로그인 필요 |
paperzilla | 논문 추천 | Paperzilla 프로젝트 피드·추천 논문 조회 | /paperzilla 이번 주 내 프로젝트 추천 논문 요약해 줘 | Paperzilla 계정 필요 |
parallel-web | 웹 리서치 | Parallel로 웹 검색·딥리서치·자료 추출 | /parallel-web 국내 mRNA 백신 기업 최신 동향 조사해 줘 | Parallel API 키 필요 |
peer-review | 논문 심사 | 원고 동료 심사 의견 초안 작성 | /peer-review 이 원고 심사 의견서 초안 써 줘 | 없음 |
pyzotero | Zotero 연동 | Zotero 서지 라이브러리 조회·추가·정리 | /pyzotero 내 Zotero 컬렉션 논문 목록 뽑아 줘 | Zotero API 키 필요(비공개 라이브러리) |
research-lookup | 연구 근거 수집 | 원고·브리프용 최신 학술 근거 수집 | /research-lookup 내 서론에 넣을 최신 근거 논문 모아 줘 | Parallel 또는 OpenRouter 키 필요 |
scholar-evaluation | 학술 성과 평가 | 학술 저작물 질적 검토·평가 루브릭 점검 | /scholar-evaluation 내 학위논문 초안 강약점 검토해 줘 | 없음 |
scientific-brainstorming | 연구 브레인스토밍 | 연구 아이디어 발산·평가·반론 검토 | /scientific-brainstorming 마이크로바이옴 후속 연구 아이디어 뽑아 줘 | 없음 |
scientific-critical-thinking | 근거 비판 평가 | 과학적 주장·근거 질·편향 평가 | /scientific-critical-thinking 이 논문 결론이 타당한지 평가해 줘 | AI 도식은 OpenRouter 키(선택) |
글쓰기·발표 (13개)
| 스킬 | 한글 이름 | 하는 일 | 바로 쓰는 프롬프트 | 필요한 것 |
|---|---|---|---|---|
dhdna-profiler | 글쓰기 성향 분석 | 글의 사고·문체 패턴을 탐색적으로 분석 | /dhdna-profiler 내 논문 서론의 사고 패턴 분석해 줘 | 없음 |
generate-image | AI 이미지 생성 | OpenRouter로 이미지 생성·편집 | /generate-image 세포 분열 과정 표지 일러스트 만들어 줘 | OpenRouter 키 필요(유료) |
infographics | 인포그래픽 | 데이터로 인포그래픽 생성·검토 | /infographics 내 연구 결과 3가지 인포그래픽으로 만들어 줘 | OpenRouter 키 필요 |
latex-posters | LaTeX 포스터 | LaTeX로 학회 연구 포스터 제작 | /latex-posters 내 논문으로 A0 학회 포스터 만들어 줘 | AI 도식은 OpenRouter 키(선택) |
markdown-mermaid-writing | 마크다운 도식 | 마크다운 문서와 Mermaid 다이어그램 작성 | /markdown-mermaid-writing 내 실험 절차 Mermaid 흐름도로 그려 줘 | 없음 |
market-research-reports | 시장 조사 보고서 | 근거 추적 시장 조사 보고서·시장 규모 추정 | /market-research-reports 국내 진단키트 시장 규모 보고서 써 줘 | 없음 |
pptx-posters | PPT 포스터 | 편집 가능한 PPT 학회 포스터 제작·점검 | /pptx-posters 내 연구 내용으로 PPT 학회 포스터 만들어 줘 | 없음 |
research-grants | 연구비 제안서 | NIH·NSF 등 연구비 제안서 작성·검토 | /research-grants NIH R01 구체적 목표(Aims) 초안 써 줘 | AI 도식은 OpenRouter 키(선택) |
scientific-schematics | 과학 도식 | AI로 과학 다이어그램 초안 생성·개선 | /scientific-schematics CRISPR 작동 원리 도식 그려 줘 | OpenRouter 키 필요 |
scientific-slides | 발표 슬라이드 | 학회·세미나·디펜스 발표 슬라이드 제작 | /scientific-slides 내 논문으로 15분 학회 발표 슬라이드 만들어 줘 | AI 생성은 OpenRouter 키 필요 |
scientific-visualization | 논문용 그림 | 출판 수준 과학 그림·다중 패널 제작 | /scientific-visualization 이 결과로 저널용 4패널 그림 만들어 줘 | 없음 |
scientific-writing | 논문 작성 | 과학 원고 초안 작성·수정·점검 | /scientific-writing 내 실험 결과로 논문 방법 섹션 써 줘 | 없음 |
venue-templates | 투고 양식 | 저널·학회 LaTeX 양식으로 원고 준비 | /venue-templates 내 원고 Nature 투고 양식으로 맞춰 줘 | 없음 |
데이터 분석·통계 (31개)
| 스킬 | 한글 이름 | 하는 일 | 바로 쓰는 프롬프트 | 필요한 것 |
|---|---|---|---|---|
aeon | 시계열 머신러닝 | 시계열 분류·예측·이상 탐지·군집화 | /aeon 센서 시계열 데이터로 이상 구간 탐지해 줘 | 없음 |
arbor | 실험 가설 트리 | 가설 트리로 모델·벤치마크 개선 실험 반복 관리 | /arbor 분류 모델 정확도 올릴 가설 트리 만들어 실험해 줘 | 자율 모델 호출 시 LLM 키 필요(선택) |
dask | 대용량 병렬 처리 | 메모리 넘는 데이터 Dask로 병렬 처리 | /dask 50GB CSV 파일 병렬로 집계해 줘 | 없음 |
database-lookup | 공개 DB 조회 | 공개 데이터베이스 API로 사실 조회·출처 기록 | /database-lookup 공개 DB에서 이 유전자 정보 출처 포함 조회해 줘 | 없음 |
datalad | 데이터 버전 관리 | DataLad로 연구 데이터 버전·출처 관리 | /datalad 공개 데이터셋 클론하고 분석 실행 기록 남겨 줘 | 없음 |
experimental-design | 실험 설계 | 데이터 수집 전 실험 설계·무작위화·블록 배치 | /experimental-design 비료 3종×물 2수준 실험 배치 짜 줘 | 없음 |
exploratory-data-analysis | 탐색적 분석 | 과학 데이터 파일 구조·분포 빠른 탐색 | /exploratory-data-analysis 이 CSV 파일 결측치랑 분포 요약해 줘 | 없음 |
hugging-science | 과학 AI 자료 | Hugging Science에서 과학 데이터셋·모델 찾기 | /hugging-science 단백질 구조 예측용 공개 모델 찾아 줘 | 없음 |
matlab | MATLAB 코드 | MATLAB·Octave 수치 계산 코드 작성·이전 | /matlab 이 MATLAB 코드 파이썬으로 옮겨 줘 | 없음 |
matplotlib | 그래프 그리기 | Matplotlib으로 세밀한 과학 그래프 제작 | /matplotlib 이 데이터로 논문용 오차막대 그래프 그려 줘 | 없음 |
networkx | 네트워크 분석 | 그래프 구조·중심성·최단경로 분석 | /networkx 공저자 네트워크 만들고 중심 인물 찾아 줘 | 없음 |
polars | 고속 데이터프레임 | Polars로 빠른 데이터 처리·pandas 전환 | /polars 이 pandas 코드 Polars로 빠르게 바꿔 줘 | 없음 |
pufferlib | 강화학습 환경 | PufferLib 강화학습 환경·학습·평가 | /pufferlib 내 강화학습 환경 PufferLib로 학습 설정해 줘 | 없음 |
pymc | 베이지안 모델 | PyMC 베이지안 계층모델·MCMC | /pymc 학교별 성적 데이터로 계층 베이지안 모델 만들어 줘 | 없음 |
pymoo | 다목적 최적화 | NSGA-II 등 다목적 최적화·파레토 해 | /pymoo 비용과 성능 두 목표 최적화 파레토 해 구해 줘 | 없음 |
pytorch-lightning | 딥러닝 학습 | PyTorch Lightning으로 모델 학습 구조화 | /pytorch-lightning 내 PyTorch 코드 Lightning으로 정리해 줘 | 없음 |
scikit-learn | 머신러닝 | 분류·회귀·군집 등 머신러닝 모델 | /scikit-learn 이 데이터로 랜덤포레스트 분류 모델 만들어 줘 | 없음 |
scikit-survival | 생존 분석 | 생존분석 모델 학습·평가 | /scikit-survival 환자 추적 데이터로 생존 예측 모델 만들어 줘 | 없음 |
seaborn | 통계 그래프 | Seaborn 분포·관계·히트맵 통계 시각화 | /seaborn 이 데이터 그룹별 바이올린 플롯 그려 줘 | 없음 |
shap | 모델 해석 | SHAP으로 머신러닝 예측 기여도 설명 | /shap 내 예측 모델 변수 중요도 SHAP으로 보여 줘 | 없음 |
stable-baselines3 | 강화학습 | PPO·SAC 등 강화학습 학습·평가 | /stable-baselines3 CartPole을 PPO로 학습시켜 줘 | 없음 |
statistical-analysis | 통계 분석 | 검정 선택·가정 확인·효과크기·APA 보고 | /statistical-analysis 세 그룹 평균 차이 적절한 검정으로 분석해 줘 | 없음 |
statistical-power | 표본 수 계산 | 검정력 분석으로 필요한 표본 수 계산 | /statistical-power 효과크기 0.5일 때 필요한 표본 수 알려 줘 | 없음 |
statsmodels | 통계 모델 | 회귀·GLM·혼합모델·ARIMA 적합 | /statsmodels 이 데이터로 로지스틱 회귀하고 결과 해석해 줘 | 없음 |
timesfm-forecasting | 시계열 예측 | TimesFM으로 학습 없이 시계열 예측 | /timesfm-forecasting 월별 판매 데이터 6개월 예측해 줘 | 없음 |
torch-geometric | 그래프 신경망 | PyG로 GCN·GAT 등 그래프 신경망 | /torch-geometric 분자 그래프로 GCN 분류 모델 만들어 줘 | 없음 |
transformers | 트랜스포머 모델 | Hugging Face 모델 추론·미세조정 | /transformers 이 텍스트 분류 모델 미세조정해 줘 | 비공개 모델은 HF 토큰 필요(선택) |
umap-learn | UMAP 차원축소 | UMAP으로 고차원 데이터 2D·3D 임베딩 | /umap-learn 이 고차원 데이터 UMAP으로 2D 시각화해 줘 | 없음 |
usfiscaldata | 미 재정 데이터 | 미국 재무부 재정 데이터 API 조회 | /usfiscaldata 최근 5년 미국 국가부채 추이 가져와 줘 | 없음 |
vaex | 초대형 표 처리 | 메모리 넘는 대형 표 데이터 처리·시각화 | /vaex 10억 행 HDF5 파일 통계 요약해 줘 | 없음 |
zarr-python | Zarr 저장 | 대용량 N차원 배열 Zarr 청크 저장·조회 | /zarr-python 이 대용량 이미지 배열 Zarr로 저장해 줘 | 없음 |
생물·유전체 (56개)
| 스킬 | 한글 이름 | 하는 일 | 바로 쓰는 프롬프트 | 필요한 것 |
|---|---|---|---|---|
13c-metabolic-flux | 대사 플럭스 | 13C 동위원소 추적으로 세포 내 대사 흐름 추정 | /13c-metabolic-flux 포도당 13C 표지 데이터로 대사 플럭스 계산해 줘 | 없음 |
adaptyv | 단백질 실험 의뢰 | Adaptyv 랩에 단백질 결합·안정성 실험 의뢰·결과 조회 | /adaptyv 설계한 단백질 서열 5개 결합 실험 비용 견적 내 줘 | Adaptyv 계정·토큰 필요 |
alphagenome | 변이 효과 예측 | AlphaGenome으로 유전 변이의 조절 효과 점수 조회 | /alphagenome chr7 이 SNV가 유전자 발현에 주는 영향 알려 줘 | AlphaGenome API 키 필요(무료·비상업) |
anndata | 단일세포 데이터 | h5ad 단일세포 데이터 구조 읽기·편집·변환 | /anndata 이 h5ad 파일 구조 확인하고 메타데이터 정리해 줘 | 없음 |
arboreto | 유전자 조절망 | 발현 데이터로 유전자 조절 네트워크 추론 | /arboreto 단일세포 발현 데이터로 전사인자 조절망 추론해 줘 | 없음 |
benchling-integration | 벤치링 연동 | Benchling 레지스트리·재고·실험노트 자동화 | /benchling-integration 이번 달 등록된 플라스미드 목록 뽑아 줘 | Benchling 계정·API 키 필요 |
biopython | 서열 분석 | 서열 파일 처리·계통수·NCBI 검색 | /biopython 이 FASTA 서열들 GC 함량 계산해 줘 | 없음 |
bioservices | 생물 DB 조회 | UniProt·KEGG·Reactome 등 생물 DB 통합 조회 | /bioservices TP53 단백질 정보와 관련 KEGG 경로 찾아 줘 | 없음 |
bulk-rnaseq | 벌크 RNA 분석 | RNA-seq 정량 결과를 차등발현 분석용으로 준비 | /bulk-rnaseq Salmon 결과로 유전자 수준 카운트 표 만들어 줘 | 없음 |
cellprofiler | 세포 이미지 분석 | 현미경 이미지 핵 분할·세포 수·형광 측정 | /cellprofiler 형광 현미경 사진에서 세포 수 세 줘 | 없음 |
cellxgene-census | 공개 단일세포 | CELLxGENE 공개 단일세포 데이터 조회·다운로드 | /cellxgene-census 사람 폐 조직 T세포 발현 데이터 가져와 줘 | 없음 |
cobrapy | 대사 모델링 | COBRApy로 FBA·유전자 결실 대사 모델 분석 | /cobrapy 대장균 모델에서 유전자 결실 시 성장률 계산해 줘 | 없음 |
deepspot-m | 가상 공간전사체 | H&E 조직 이미지로 공간 유전자 발현 예측 | /deepspot-m 이 H&E 슬라이드로 유전자 발현 지도 예측해 줘 | Hugging Face 접근 승인 필요 |
deeptools | NGS 시각화 | BAM→bigWig 변환·ChIP/ATAC 히트맵·QC | /deeptools ChIP-seq BAM으로 TSS 주변 히트맵 그려 줘 | 없음 |
depmap | 암 의존성 DB | DepMap 암세포 유전자 의존성·약물 반응 분석 | /depmap KRAS 변이 세포주에서 필수 유전자 찾아 줘 | 없음 |
dnanexus-integration | DNAnexus | DNAnexus 클라우드에서 유전체 분석 워크플로 실행 | /dnanexus-integration DNAnexus에 변이 분석 워크플로 올려 줘 | DNAnexus 계정 필요 |
esm | 단백질 언어모델 | ESM3 단백질 생성·임베딩·구조 예측 | /esm 이 단백질 서열 임베딩 뽑고 구조 예측해 줘 | 호스팅 사용 시 ESM API 키 필요(선택) |
etetoolkit | 계통수 편집 | ETE로 계통수 읽기·비교·주석·시각화 | /etetoolkit 이 Newick 계통수 두 개 위상 비교해 줘 | 없음 |
flowio | FCS 파일 처리 | 유세포 분석 FCS 파일 읽기·쓰기 | /flowio 이 FCS 파일 채널 정보와 이벤트 수 보여 줘 | 없음 |
flowkit | 유세포 분석 | 유세포 보정·변환·게이팅 분석 | /flowkit FCS 파일로 CD4+ T세포 게이팅해 줘 | 없음 |
geniml | 게놈 구간 임베딩 | BED 구간 데이터 Region2Vec 임베딩 작업 점검 | /geniml 이 BED 파일들로 Region2Vec 학습 계획 세워 줘 | 없음 |
genomic-coordinates | 게놈 좌표 변환 | 게놈 좌표계·변이 표기 변환과 어셈블리 불일치 점검 | /genomic-coordinates 이 BED 좌표 0-based를 1-based로 바꿔 줘 | 없음 |
genomic-intelligence | DNA 서열 예측 | DNA 언어모델로 조절 영역·유전자 구조 예측 | /genomic-intelligence 이 DNA 서열에서 프로모터 위치 예측해 줘 | GI API 키 필요(데모는 무료) |
gget | 유전자 빠른 조회 | 유전자 정보·BLAST·구조·농축분석 빠른 조회 | /gget BRCA2 유전자 정보와 서열 가져와 줘 | 없음 |
ginkgo-cloud-lab | 클라우드 랩 주문 | Ginkgo 클라우드 랩 단백질 발현 실험 주문 | /ginkgo-cloud-lab 이 단백질 대장균 발현 실험 견적 알아봐 줘 | Ginkgo 계정 필요 |
glycoengineering | 당화 분석 | 단백질 당화 부위 탐색·당쇄 엔지니어링 | /glycoengineering 이 항체 서열의 N-당화 부위 찾아 줘 | 없음 |
gtars | 게놈 구간 연산 | 게놈 구간 겹침·커버리지·토큰화 계산 | /gtars 두 BED 파일 겹치는 구간 세 줘 | 없음 |
lamindb | 생물 데이터 관리 | LaminDB로 데이터셋 등록·계보·스키마 관리 | /lamindb 실험 데이터 등록하고 처리 이력 추적해 줘 | 없음 |
latchbio-integration | Latch 연동 | Latch 플랫폼 생물정보 워크플로 구축·실행 | /latchbio-integration RNA-seq 파이프라인 Latch에 올려 줘 | Latch 계정 필요 |
mageck | CRISPR 분석 | CRISPR 스크린 카운트로 유전자 히트 순위 분석 | /mageck CRISPR 스크린 카운트로 필수 유전자 순위 매겨 줘 | 없음 |
ncats-arax | 생의학 지식그래프 | NCATS ARAX 생의학 지식그래프 관계 조회 | /ncats-arax 메트포르민과 연결된 유전자·질환 찾아 줘 | 없음 |
neuropixels-analysis | 뉴로픽셀 분석 | Neuropixels 신경 기록 전처리·스파이크 정렬 | /neuropixels-analysis 이 녹화 데이터 Kilosort로 스파이크 정렬해 줘 | 없음 |
nextflow | Nextflow | Nextflow·nf-core 파이프라인 작성·실행·디버깅 | /nextflow nf-core/rnaseq 실행 설정 만들어 줘 | 없음 |
nwb-conversion | NWB 변환 | 신경과학 데이터를 NWB 형식으로 변환·검증 | /nwb-conversion 이 전기생리 데이터 NWB 파일로 변환해 줘 | 없음 |
omero-integration | OMERO 연동 | OMERO 서버 현미경 이미지·주석 자동화 | /omero-integration OMERO 데이터셋 이미지 목록 뽑아 줘 | OMERO 서버 계정 필요 |
onekgpd | 1000게놈 조회 | 1000 Genomes 개인·변이 단위 조회 | /onekgpd 이 변이를 가진 1000 Genomes 개인 수 알려 줘 | 없음 |
ontology-term-resolution | 온톨로지 용어 | 자유 텍스트를 온톨로지 ID로 매핑·검증 | /ontology-term-resolution 조직 이름들 UBERON ID로 바꿔 줘 | 없음 |
pacsomatic | 종양 유전체 | PacBio HiFi 종양-정상 쌍 분석 파이프라인 실행 | /pacsomatic 종양·정상 BAM으로 샘플시트 만들어 줘 | 없음 |
pathogen-variant-surveillance | 병원체 변이 감시 | 병원체 계통·변이 빈도 공개 데이터 조회 | /pathogen-variant-surveillance 최근 코로나 변이 비율 알려 줘 | 없음 |
pathway-enrichment | 경로 농축 분석 | 유전자 목록으로 경로·GO 농축 분석 | /pathway-enrichment 차등발현 유전자로 KEGG 농축 분석해 줘 | 없음 |
phylogenetics | 계통 분석 | MAFFT 정렬·IQ-TREE로 계통수 추정 | /phylogenetics 이 서열들 정렬하고 계통수 만들어 줘 | 없음 |
polars-bio | 게놈 구간 처리 | Polars로 게놈 구간 연산·유전체 파일 읽기 | /polars-bio VCF 변이와 유전자 BED 겹치는 것 찾아 줘 | 없음 |
primer-design | 프라이머 설계 | PCR·qPCR 프라이머 설계와 비특이 결합 검사 | /primer-design GAPDH qPCR 프라이머 3쌍 설계해 줘 | 없음 |
protocolsio-integration | 프로토콜 조회 | protocols.io 프로토콜 조회·검증·내보내기 | /protocolsio-integration 웨스턴 블롯 공개 프로토콜 찾아 줘 | 조회 시 토큰 필요할 수 있음 |
pydeseq2 | 차등발현 분석 | PyDESeq2로 RNA-seq 차등발현 분석 | /pydeseq2 처리군 대조군 카운트로 차등발현 유전자 찾아 줘 | 없음 |
pysam | BAM 처리 | pysam으로 SAM/BAM·VCF 읽기·필터링 | /pysam 이 BAM에서 특정 구간 커버리지 계산해 줘 | 없음 |
qiime2-amplicon | 16S 미생물 | QIIME 2로 16S 앰플리콘 ASV·분류 분석 | /qiime2-amplicon 장내미생물 16S 데이터 분류군 분석해 줘 | 없음 |
relion | 크라이오EM | RELION 단입자 Cryo-EM 정제·후처리 | /relion 이 입자 데이터로 3D 정제 설정 점검해 줘 | 없음 |
relsa-severity-assessment | 동물실험 고통도 | RELSA 점수로 실험동물 고통 정도 평가 | /relsa-severity-assessment 쥐 체중·점수 데이터로 고통도 평가해 줘 | 없음 |
scanpy | 단일세포 분석 | 단일세포 RNA-seq QC·군집·UMAP 분석 | /scanpy 10x 데이터 QC하고 세포 군집 UMAP 그려 줘 | 없음 |
scikit-bio | 미생물 다양성 | 서열·다양성 지수·PCoA·PERMANOVA 분석 | /scikit-bio 미생물 군집 알파·베타 다양성 계산해 줘 | 없음 |
scvelo | RNA 속도 분석 | scVelo로 단일세포 RNA 속도·분화 궤적 분석 | /scvelo 이 단일세포 데이터 RNA velocity 분석해 줘 | 없음 |
scvi-tools | 단일세포 통합 | scVI로 단일세포 배치 통합·세포 주석 | /scvi-tools 두 배치 단일세포 데이터 통합해 줘 | 없음 |
tellurium | 생화학 반응 모델 | SBML 생화학 반응속도 모델 시뮬레이션 | /tellurium 이 SBML 모델 시간에 따른 농도 시뮬레이션해 줘 | 없음 |
tiledbvcf | 대용량 변이 저장 | TileDB-VCF로 VCF 변이 저장·구간 조회 | /tiledbvcf VCF 100개 묶어 저장하고 구간 조회해 줘 | 없음 |
waypoint-bio | 미생물 기반모델 | Waypoint 미생물 군집 기반모델 활용 | /waypoint-bio 미생물 군집 데이터로 Waypoint 임베딩 뽑아 줘 | Hugging Face 접근 승인 필요 |
화학·신약 (18개)
| 스킬 | 한글 이름 | 하는 일 | 바로 쓰는 프롬프트 | 필요한 것 |
|---|---|---|---|---|
analytical-method-validation | 분석법 밸리데이션 | ICH Q2 기준 분석법 검증 계획·통계·문서화 | /analytical-method-validation HPLC 정량법 밸리데이션 계획서 짜 줘 | 없음 |
cantera | 연소 반응 계산 | 화학 반응기·점화 지연 시뮬레이션 | /cantera 메탄-공기 혼합물 점화 지연 시간 계산해 줘 | 없음 |
datamol | 분자 처리 | RDKit 기반 SMILES 표준화·지문·클러스터링 | /datamol 이 SMILES 목록 표준화하고 유사도로 묶어 줘 | 없음 |
deepchem | 분자 물성 예측 | DeepChem으로 분자 물성 예측 모델 학습 | /deepchem 용해도 데이터로 분자 물성 예측 모델 만들어 줘 | 없음 |
diffdock | 분자 도킹 | DiffDock으로 단백질-리간드 결합 자세 예측 | /diffdock 이 단백질 PDB에 SMILES 리간드 도킹해 줘 | 없음 |
marine-carbonate-chemistry | 해양 탄산 화학 | 해수 탄산계·pH·해양 산성화 계산 | /marine-carbonate-chemistry 알칼리도와 DIC로 해수 pH 계산해 줘 | 없음 |
matchms | 질량분석 스펙트럼 | MS/MS 스펙트럼 정리·유사도·라이브러리 검색 | /matchms 이 MGF 스펙트럼 라이브러리와 매칭해 줘 | 없음 |
medchem | 약물성 필터 | Lipinski·PAINS 등 약물성 규칙으로 화합물 선별 | /medchem 이 화합물 목록 PAINS 구조 걸러 줘 | 없음 |
molecular-dynamics | 분자동역학 | OpenMM 분자동역학 시뮬레이션·궤적 분석 | /molecular-dynamics 이 단백질 10ns 분자동역학 돌려 줘 | 없음 |
molfeat | 분자 특징 추출 | 분자 지문·기술자·사전학습 임베딩 생성 | /molfeat 이 SMILES들 ECFP 지문으로 변환해 줘 | 없음 |
nmrglue | NMR 처리 | 1D NMR 원신호 위상 보정·피크·적분 | /nmrglue 이 1H NMR FID 처리해서 피크 찾아 줘 | 없음 |
pkpd-modeling | 약동·약력학 | 약동학(PK)·약력학(PD) 분석·시뮬레이션 | /pkpd-modeling 혈중 농도 데이터로 AUC·반감기 계산해 줘 | 없음 |
pyopenms | 질량분석 오믹스 | pyOpenMS로 단백체·대사체 질량분석 처리 | /pyopenms 이 mzML 파일 피처 검출해 줘 | 없음 |
pytdc | 신약 벤치마크 | TDC 신약 데이터셋·분할·평가 지표 | /pytdc 독성 예측 벤치마크 데이터셋 불러와 줘 | 없음 |
rdkit | 화학정보학 | RDKit 분자 파싱·기술자·부분구조 검색 | /rdkit 이 SMILES들 분자량과 LogP 계산해 줘 | 없음 |
rowan | 분자 계산 | Rowan으로 pKa·형태·도킹 등 분자 계산 | /rowan 이 분자 pKa 예측해 줘 | Rowan API 키 필요 |
tamarind | 분자 설계 도구 | Tamarind로 구조 예측·분자 설계 도구 사용 | /tamarind 이 단백질 서열 구조 예측 돌려 줘 | Tamarind 계정·API 키 필요 |
torchdrug | 신약 딥러닝 | TorchDrug 분자 물성 예측·생성·역합성 | /torchdrug 분자 물성 예측 그래프 모델 학습시켜 줘 | 없음 |
의학·임상 (13개)
| 스킬 | 한글 이름 | 하는 일 | 바로 쓰는 프롬프트 | 필요한 것 |
|---|---|---|---|---|
bids | 뇌영상 BIDS | MRI·EEG 데이터 BIDS 구조 정리·검증·변환 | /bids 이 MRI DICOM 폴더를 BIDS 형식으로 정리해 줘 | 없음 |
clinical-decision-support | 임상 근거 검증 | 연구용 임상 근거·코호트·생존분석 자료 검증 | /clinical-decision-support 바이오마커 모델 평가 근거표 만들어 줘 | 없음 |
clinical-reports | 임상 보고서 | 증례·임상시험·안전성 보고서 초안·점검 | /clinical-reports 비식별 증례로 증례보고서 초안 구조 잡아 줘 | 없음 |
folklore-variant-evidence | 변이 임상 근거 | ClinGen 유전자-질환 근거와 변이 문헌 검토 | /folklore-variant-evidence BRCA1 이 변이 병원성 근거 정리해 줘 | 없음 |
histolab | 병리 타일 추출 | 병리 전체 슬라이드 이미지 타일 추출·염색 정규화 | /histolab 이 병리 슬라이드에서 조직 타일 뽑아 줘 | 없음 |
imaging-data-commons | 암 영상 DB | NCI 공개 암 영상(CT·MR·병리) 조회·다운로드 | /imaging-data-commons 폐암 CT 공개 데이터셋 찾아 줘 | BigQuery 사용 시 구글 계정 필요(선택) |
iso-standards-readiness | ISO 인증 준비 | ISO 13485·17025 등 인증 준비 자료 점검 | /iso-standards-readiness ISO 17025 심사 대비 체크리스트 만들어 줘 | 없음 |
neurokit2 | 생체신호 분석 | 심전도·호흡·피부전도 등 생체신호 처리 | /neurokit2 이 심전도 데이터로 심박변이도 계산해 줘 | 없음 |
pathml | 디지털 병리 | PathML로 병리 슬라이드 타일링·전처리·추론 | /pathml 병리 슬라이드 타일링하고 품질 점검해 줘 | 없음 |
primekg | 정밀의학 KG | PrimeKG로 유전자·약물·질환 관계 조회 | /primekg 알츠하이머 관련 약물과 유전자 경로 찾아 줘 | 없음 |
pydicom | DICOM 처리 | 의료영상 DICOM 메타데이터·픽셀 읽기·변환 | /pydicom 이 DICOM 폴더 환자정보 지우고 이미지로 저장해 줘 | 없음 |
pyhealth | 의료 AI | EHR·의료코드 임상 머신러닝 파이프라인 | /pyhealth MIMIC-IV로 재입원 예측 모델 만들어 줘 | 없음 |
treatment-plans | 치료 계획서 서식 | 확정된 치료 계획 문서 서식화·구조 검증 | /treatment-plans 확정된 치료 내용 계획서 서식으로 정리해 줘 | 없음 |
물리·공학·기타 (27개)
| 스킬 | 한글 이름 | 하는 일 | 바로 쓰는 프롬프트 | 필요한 것 |
|---|---|---|---|---|
astropy | 천문 데이터 | 천문 좌표·단위·FITS 파일·우주론 계산 | /astropy 이 FITS 이미지 열어서 천체 좌표 변환해 줘 | 없음 |
autoskill | 스킬 자동 생성 | 작업 기록에서 반복 연구 흐름 찾아 스킬 초안 생성 | /autoskill 지난주 내 작업 기록 보고 반복 작업 스킬로 만들어 줘 | Screenpipe·로컬 LLM 필요 |
cirq | 구글 양자회로 | Cirq로 양자회로 설계·노이즈 시뮬레이션 | /cirq 3큐비트 GHZ 상태 회로 만들고 시뮬레이션해 줘 | 클라우드 실행 시 계정 필요(선택) |
consciousness-council | 다관점 토론 | 여러 관점 협의회로 결정·연구 쟁점 토론 | /consciousness-council 박사 진학과 취업 중 뭘 할지 토론해 줘 | 없음 |
fictiv | 부품 제작 주문 | Fictiv에 CAD 부품 업로드·견적·주문 | /fictiv 이 STEP 파일 알루미늄 CNC 견적 받아 줘 | Fictiv 계정 로그인 필요 |
fluidsim | 유체 시뮬레이션 | FluidSim 전산유체 시뮬레이션 설정·분석 | /fluidsim 2차원 난류 시뮬레이션 설정하고 결과 분석해 줘 | 없음 |
geomaster | 공간정보 분석 | 위성영상·GIS·공간통계 분석 | /geomaster 위성영상으로 식생지수(NDVI) 계산해 줘 | 없음 |
geopandas | 지도 데이터 | GeoPandas로 벡터 지도 데이터 공간 분석 | /geopandas 시군구 경계 파일에 인구 데이터 합쳐 지도 그려 줘 | 없음 |
get-available-resources | 자원 점검 | CPU·메모리·GPU 등 계산 자원 확인 | /get-available-resources 지금 컴퓨터로 이 분석 돌릴 수 있는지 봐 줘 | 없음 |
lab-hardware-cad | 실험 장비 CAD | 실험실 맞춤 부품 3D 모델 설계·STL 출력 | /lab-hardware-cad 50ml 튜브 거치대 3D 프린팅 모델 만들어 줘 | 없음 |
labarchive-integration | 전자연구노트 | LabArchives 전자연구노트·재고 API 연동 | /labarchive-integration 내 연구노트 목록 불러와 줘 | LabArchives 접근 키 필요 |
modal | 클라우드 GPU | Modal 서버리스 클라우드로 GPU 작업 실행 | /modal 이 학습 코드 Modal GPU에서 돌려 줘 | Modal 계정 필요(GPU는 결제수단) |
openpiv | 유속 측정 PIV | PIV 이미지 쌍으로 유체 속도장 추출 | /openpiv 이 PIV 이미지 쌍으로 속도장 계산해 줘 | 없음 |
opentrons-integration | 분주 로봇 | Opentrons 분주 로봇 프로토콜 작성·시뮬레이션 | /opentrons-integration 96웰 연속 희석 프로토콜 짜 줘 | 없음 |
optimize-for-gpu | GPU 가속 | 과학 파이썬 코드를 GPU로 가속·검증 | /optimize-for-gpu 이 NumPy 코드 GPU로 빠르게 바꿔 줘 | 없음 |
pennylane | 양자 머신러닝 | PennyLane 양자회로·VQE·양자 머신러닝 | /pennylane 수소 분자 VQE 에너지 계산해 줘 | 없음 |
pi-agent | Pi 에이전트 | Pi 터미널 코딩 에이전트 설치·설정·확장 | /pi-agent Pi 설치하고 모델 설정해 줘 | 없음 |
pybamm | 배터리 시뮬레이션 | 리튬이온 배터리 충방전 시뮬레이션 | /pybamm 1C 방전 전압 곡선 시뮬레이션해 줘 | 없음 |
pycalphad | 상평형 계산 | CALPHAD 열역학 DB로 합금 상평형 계산 | /pycalphad 이 TDB 파일로 Al-Zn 상태도 그려 줘 | 없음 |
pylabrobot | 실험 자동화 | PyLabRobot 분주 로봇 프로토콜·시뮬레이션 | /pylabrobot 분주 로봇 플레이트 옮기기 시뮬레이션해 줘 | 없음 |
pymatgen | 재료 구조 분석 | 결정 구조·상태도·재료 데이터 분석 | /pymatgen 이 CIF 구조 대칭성 분석해 줘 | Materials Project 키 필요(선택) |
qiskit | IBM 양자회로 | Qiskit 양자회로 설계·시뮬레이션·실행 | /qiskit 벨 상태 회로 만들고 시뮬레이션해 줘 | IBM 실기기는 계정·키 필요(선택) |
qutip | 양자계 시뮬레이션 | QuTiP로 열린·닫힌 양자계 동역학 계산 | /qutip 2준위 원자 라비 진동 시뮬레이션해 줘 | 없음 |
simpy | 이산 사건 시뮬 | SimPy로 대기열·자원 이산 사건 시뮬레이션 | /simpy 병원 대기열 시뮬레이션 만들어 줘 | 없음 |
sympy | 기호 수학 | SymPy로 방정식·미적분 기호 계산 | /sympy 이 미분방정식 해석해로 풀어 줘 | 없음 |
uncertainty-and-units | 단위·불확도 | 물리 단위 변환과 측정 불확도 전파 | /uncertainty-and-units 이 측정값들 불확도 전파 계산해 줘 | 없음 |
what-if-oracle | 가정 시나리오 | 연구 계획 what-if 시나리오 분석 | /what-if-oracle 시약 공급 끊기면 연구 일정 시나리오 짜 줘 | 없음 |
링크
- 저장소: https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills
- 이 스킬을 만든 곳: K-Dense
담PD가 노션에 공개한 자료를 이미지·글 그대로 옮겨 온 아카이브입니다. 최신 내용과 업데이트는 원문에서 확인하세요.
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